La rehabilitación, que se está realizando a través de la Dirección General de Patrimonio Histórico y al amparo del convenio suscrito entre la Comunidad de Madrid y la Provincia Eclesiástica, cuenta con un presupuesto de 754.937 euros. El proyecto de las obras lo ha realizado y las dirige el arquitecto José Félix Fernández.

De las obras que en estos momentos se están realizando en el interior de la Iglesia destaca la colocación y el montaje de la cubierta y artesonado, y ya se han realizado reformas en la nave de la iglesia, en la cubierta (demoliciones y desmontaje, armadura), en las fachadas (limpieza, preparación y tratamiento de paramentos, reconstrucción de troneras) en el interior, instalaciones eléctricas y de iluminación, campanario y coro. Asimismo, destaca la intervención en la antigua armadura de la iglesia, que ha dirigido el arquitecto Enrique Nuere.

Según la documentación con la que cuenta la Parroquia de Perales de Tajuña, esta Iglesia se fundó a comienzos del siglo XVI.