En excedencia especial de Adif, desde enero de 2014 hasta septiembre de 2016 Aguilar ha ocupado el cargo de director general de Renfe Mercancías. Fue, además, presidente de FEVE y de Comfersa.

El nuevo responsable de vivienda es arquitecto por la Escuela Técnica Superior de Arquitectura de Madrid y a lo largo de su trayectoria profesional ejerció como arquitecto del Departamento de Obras Públicas, Ordenación del Territorio y Medio Ambiente del Gobierno Vasco (1993-1999).

Posteriormente fue diputado foral de Obras Públicas y Urbanismo de la Diputación Foral de Álava; y director de Organización.