De las once especies cavernícolas existentes en la Comunidad Valenciana, dos están catalogadas en peligro de extinción: el murciélago ratonero patudo y el mediano de herradura. Por ese motivo, los estudios y censos de 2006 se han centrado en ellos.

Según ha explicado el consejero de Territorio y Vivienda, Esteban González Pons, "la Generalitat tiene una gran responsabilidad en la conservación de estas especies, sobre todo en el ratonero patudo, ya que la Comunidad Valenciana acoge la mitad de la población de Europa".