Este organismo, que se adscribe al Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino, centrará sus funciones en informar sobre las normas y planes de ámbito estatal relativas al patrimonio natural y la biodiversidad, haciendo un seguimiento de los mismos y valorando la incidencia social, económica y ambiental de las políticas públicas.

También debe informar, antes de su aprobación, sobre el Plan Estratégico Estatal del Patrimonio Natural y la Biodiversidad, acerca del informe anual sobre el estado y evolución del patrimonio natural y la biodiversidad y de las directrices para la ordenación de los recursos naturales.

Además, se encargará de informar de las estrategias de restauración de los hábitats en peligro de desaparición, de la declaración de Espacios Naturales Protegidos de ámbito estatal, de las estrategias de conservación de especies amenazadas presentes en más de una comunidad autónoma y de las estrategias de gestión, control y posible erradicación de las especies del Catálogo Español de Especies Exóticas Invasoras.

En cuanto a su composición, el Consejo estará integrado por el secretario de Estado de Medio Rural y Agua, que ejercerá su presidencia, por el secretario General de Medio Rural, que se encargará de la Vicepresidencia y varios vocales.

Se integrarán en el Consejo, con voz pero sin voto, un representante de cada comunidad autónoma, de las ciudades de Ceuta y Melilla, y un representante de la Administración local.

Se reunirá, al menos, una vez al año y será el propio presidente quien convocará las reuniones del Consejo. La duración del mandato de los miembros del Consejo será de tres años, pudiendo ser renovado dicho mandato que podrá ser renovado por igual período de tiempo.