La actuación que se ha desarrollado en este museo se enmarca dentro de las acciones del Plan Integral de Museos Estatales, promovido por el Ministerio de Educación, Cultura y Deporte y entre cuyos objetivos figura el de alcanzar el máximo nivel de calidad en el servicio público que ofrecen las instituciones museísticas y el enriqueimiento del patrimonio cultural.

El objetivo del Museo Sefardí de Toledo es conservar el legado de la cultura hispano-judía y sefardí como parte importante del patrimonio histórico español, y con su creación se pretendió reunir en un mismo edificio los testimonios de la cultura judía que se encontraban dispersos por los museos españoles. En la actualidad, el museo cuenta con una colección de 1.253 piezas.

La actuación desarrollada por parte del ministerio en el periodo 2001-2003, que ha permitidola reapertura del centro, ha consistido en la rehabilitación de la Sinagoga, que tenía graves problemas de humedad en la Gran Sala de Oración; la renovación museográfica de la exposición permanente; la dotación de una nueva iluminación al artesonado; la restauración de los elementos singulares ligados a la arquitectura, como es la azulejería; la restauración de la colección; y la intervención en un proyecto arqueológico que lleva desarrollándose desde 1987 y que ha dado como primer resultado la aparición d una casa toledana de los siglos XII y XIII.

En el acto de reapertura, el Príncipe estará acompañado por la ministra de Educación, Pilar del Castillo; el presidente de la Junta de Castilla-La Mancha, José Bono; el alcalde de Toledo, José Manuel Molina, y la delegada del Gobierno en Castilla-La Mancha, Encarnación Naharro.