El Colegio de San Gregorio es el lugar que acoge las colecciones del museo, con una cronología que abarca fundamentalmente desde el Renacimiento al Barroco. Aunque existe un predominio de la madera policromada, incluye numerosas piezas pictóricas.

La nueva denominación servirá "para poner en valor este edificio, de gran relevancia arquitectónica y significación histórico-artística", según señaló el Ministerio de Cultura en un comunicado.

Este museo nacional, de titularidad y gestión estatal, posee además otras tres sedes en Valladolid: el Palacio de Villena, la Casa del Sol y la Iglesia de San Benito el Viejo.

El decreto establece cambios en la composición y funciones del Patronato, con el fin de adaptarlo al Plan de Modernización de las Instituciones Culturales, aprobado por el Consejo de Ministros el 7 deseptiembre de 2007, y reforzar así la presencia de expertos y profesionales del área de la historia del arte y la museología en el mismo.

El Patronato lo presidirá el ministro de Cultura y tendrá como vicepresidente al presidente de la Junta de Castilla y León.

Estará integrado por los siguientes vocales natos: el consejero de Cultura de la Junta de Castilla y León, el subsecretario del Ministerio de Cultura, el director general de Bellas Artes y Bienes Culturales del Ministerio de Cultura, el alcalde de Valladolid, el arzobispo de Valladolid, el director del Museo Nacional Colegio de San Gregorio.

Además, habrá tres vocales designados por el ministro de Cultura, otro por la Real Academia de Bellas Artes de la Purísima Concepción de Valladolid, y hasta ocho vocales más, designados entre personas de reconocido prestigio en el área de la historia, el arte y la museología. Todos los vocales designados desempeñarán sus funciones por un período de tres años, a contar desde la fecha de sus respectivos nombramientos.