Aparicio, casado y con tres hijos, es licenciado en Ciencias Químicas, presidente del PP de Burgos y diputado al Congreso desde 1986.

La trayectoria política de Juan Carlos Aparicio comenzó en el Partido Liberal de José Antonio Segurado. Amigo personal de José María Aznar, ejerció como diputado autonómico en Castilla y León en los ochenta, fue primero consejero de Administración Territorial y Presidencia, y posteriormente vicepresidente del Gobierno regional que presidía entones el propio Aznar.

Aparicio es miembro del Comité Ejecutivo del Partido Popular.