El programa permitirá obtener información relativa a las enfermedades de la fauna silvestre, especialmente de aquellas que puedan ser compartidas por la cabaña ganadera, y elaborar estrategias de actuación sobre la fauna salvaje que ayuden a la erradicación y control de las enfermedades de la cabaña ganadera que son objeto de los programas nacionales de erradicación de enfermedades.

Se establece la vigilancia activa sobre distintas enfermedades, con muestreos periódicos en especies como el gamo, el jabalí, el ciervo, el conejo, la liebre, la perdiz y la paloma torcaz.