El "Hespérides" tiene previstas, en su tránsito hacia la Antártida, escalas en Tenerife, Río de Janeiro y Punta Arenas, desde donde se dirigirá a las islas de Livingston y Decepción para prestar apoyo logístico a las bases antárticas españolas "Gabriel de Castilla" y "Juan Carlos I", tanto en su apertura como en el relevo de personal y avituallamiento que se produciá a mediados de enero de 1999 y, finalmente, en su cierre a finales de febrero.

Durante su estancia en la Antártida, coincidiendo con el verano austral, los 150 investigadores y técnicos españoles y extranjeros que forman parte de la expedición, pertenecientes a diferentes organismos, desarrollarán diversos proyectos tanto en tierra como a bordo del buque.

Los trabajos de investigación que se desarrollarán a bordo del buque mejorarán el conocimiento sobre los microorganismos planctónicos en esta ona austral y contribuirán al conocimiento detallado del margen continental y cuenca norte de la península antártica.