Fuentes cercanas a la Secretaría de Estado apuntaron a Servimedia que López Garrido remitió el 21 de abril de 2008 una carta a Pere Portabella, presidente de la Fundación Alternativas, en la que "con gran pesar" le pide su renuncia como patrono de la misma.

Sin embargo, reconocen, pese a que la Fundación recibió la misiva en su página web mantuvo el nombre de López Garrido entre los patronos de la misma durante tiempo.

El Centro Jurídico Tomás Moro ha presentado una querella criminal contra López Garrido por un supuesto delito de prevaricación en la concesión de dos ayudas de 60.000 y 18.000 euros a la Fundación Alternativas, a cuyo patronato, según la denuncia, pertenecía López Garrido en el momento en el que fueron concedidas las ayudas.

Desde la Secretaría insisten en que López Garrido ya había presentado su renuncia y que estas ayudas son igual a las concedidas a múltiples universidades, asociaciones, cámaras de comercio, ayuntamientos, y que, además de la Fundación Alternativas, reciben fondos otras muchas entidades como FAES, San Pablo CEU, Instituto de Empresa, LECE, Universidad de Navarra, Federación Española de Religiosos de la Enseñanza.

La mayoría de las entidades, incluyendo a la Fundación Alternativas, reciben subvenciones desde la creación de "Hablamos de Europa" en el año 2006, "mucho antes" por tanto del nombramiento de Diego López Garrido como Secretario de Estado, sostienen desde el Ministerio de Exteriores.

Por otra parte, entre la treintena de patronos que tiene la fundación afín al PSOE figura el presidente del Gobierno, José Luis Rodríguez Zapatero. Además, entre ellos, están escritores, diplomáticos y el ex jefe del Ejecutivo Felipe Góonzález, entre otros, según la web de la Fundación Alternativas.