La exhumación comenzó antes de las 11 horas con el levantamiento de la losa de 1.500 kilos para extraer la caja fúnebre con los restos de Franco. Para evitar la imagen de ese momento, se colocó una carpa sobre el altar mayor, en la zona donde yacerán por última vez los restos mortales. Además, se limitó el acceso a dos familiares.

La ministra de Justicia, como notaria mayor del Reino, levantó acta oficial de la exhumación, el traslado y la reinhumación. Junto a la ministra estuvieron presentes como autoridades, en calidad de testigos, el secretario general de la Presidencia del Gobierno, Félix Bolaños, y el subsecretario del Ministerio de la Presidencia, Antonio Hidalgo.

En la exhumación participó también un forense para la dirección técnica de los trabajos de exhumación, así como los operarios necesarios para los trabajos. Asimismo, antes de salir al exterior, el prior del Valle, Santiago Cantera, bendijo el féretro y realizó un responso por el eterno descanso del alma de Franco y el perdón de sus pecados. Al terminar, los familiares salieron a la calle portando en hombros por todo el pasillo de la Basílica hasta la puerta principal el féretro original con el que fue enterrado en 1975, a pesar de contar con "daños" propios tras más de cuadro décadas enterrado.

Para ello, fue necesario que los operarios que participan en la exhumación en el Valle de los Caídos aseguraran primero el ataúd para su extracción de la fosa en la que ha permanecido desde que falleció y fue enterrado.