A juicio de esta asociación de teólogos progresistas, "el arzobispo de Madrid representa al sector eclesiastico de línea conservadora y tradicional que no estáen sintonía con los nuevos climas culturales. Eso a mí, no sólo me parece preocupante, sino que me asusta".

Por otra parte, Juan José Tamayo valoró positivamente la visita del Papa a Cuba, que calificó como "un viaje de relevantes consecuencias" porque "puede contribuir a revitalizar la fe de un pueblo que está en alza, así como para sembrar el germen de la democracia en Cuba, lo que sería de un servicio inestimable a la causa de los derechos humanos".

Respecto a la posibilidad apuntada por monseor Carles, el arzobispo de Barcelona, de que el próximo Pontífice sea un prelado latinoamericano, Juan José Tamayo lo consideró "poco probable" y afirmó que "de todas formas no sería de mi agrado, ya que el episcopado latinoamericano actual sigue una línea conservadora y no la opción por los pobres".