El ataque se produjo pasadas las 2 de la madrugada, cuando los encapuchados, provistos de cócteles incendiarios, obligaron a un agente de seguridad a que les abriera la puerta del edificio. A continuación lnzaron varios de estos artefactos incendiarios, que provocaron un incendio en el despacho del director del apeadero, que quedó totalmente destrozado.

La compañía de ferrocarriles vascos ha destacado que esta es la segunda vez en menos de un año que esta dependencia sufre un atentado de estas características y sus consecuencias las sufren los usuarios del tren que une las localidades de San Sebastián y Hendaya (Francia).