El águila imperial está considerada como una de las siete especies de ave de presa más amenazada en todo el mundo, por lo que los expertos de la Estación Biológica de Doñana consideran necesario adoptar medidas especiales para evitar su desaparición.

Aunque la población española inició una ligera recuperación durante los últimos años, las muertes por electrocución continúan siendo el principal problema que sufren estas aves.

En el Parque Nacional de Doñana este problema quedó soluciondo hace unos años, como consecuencia del convenio que suscribieron la estación biológica y la Compañía Sevillana de Electricidad para modificar el diseño de los tendidos y evitar las muertes de las rapaces.

El águila imperial prácticamente ha desaparecido de Portugal y el Magreb, si bien en Marruecos todavía podría quedar alguna pareja en el macizo del Rif.