La vacuna sintética de la malaria, desarrollada en 1987, fue aprobada por la Organización Mundial de la Salud, organismo al que el investigador colombiano ha cedido la patente.

Patarroyo investiga en esos momentos una nueva vacuna contra la tuberculosis, partiendo de fragmentos sintéticos de proteínas o páctidos. Las pruebas en ratones han dado buenos resultados, pero todavía no se ha probado en humanos.