Su primer cargo político lo desempeñó como concejal en el ayuntamiento de Gijón, después fue diputado provincial, y más tarde, consejero regional en el Ente Preautonómico.

En 1982 fue elegido senador por Asturias y en 1986 dio el salto al Congreso de los Diputados, donde llegó a ser secretario general de su grupo parlamenario.

En el "congreso de la refundación" del Partido Popular, en enero de 1989, Manuel Fraga Iribarne se preocupó de situarle en la ecretaría general del partido.

Dentro de su trabajo como diputado por Asturias, Francisco Alvarez Cascos ha ocupado la secretaría general del Grupo Parlamentario, ha sido portavoz de la Comisión de Industria y portavoz del PP en la comisión de Interior.