Según fuentes del Ministerio del Portavoz del Gobierno, la finalidad fundamental de la agencia es la de preservar el cumplimiento de la Ley de Tratamiento Automatizado de los Datos de Carácter Personal, por lo que "se la reviste de unas muy singulares características y poderes que le permitan hacer efectiva tan importante labr".

Así, se proclama su plena independencia de las Administraciones públicas y se la dota de potestad de control e inspección de todos los ficheros automatizados de datos de carácter personal, con atribuciones sancionadoras en caso de infracción.

El director de la Agencia estará asesorado por un Consejo Consultivo, contará como órganos de apoyo con un Registro General, una Inspección de Datos y una Secretaría General y tendrá los mismos honores y tratamiento que los secretarios de Estado.

Eldirector será elegido entre los miembros del Consejo Consultivo y su nombramiento tendrá una duración de cuatro años en el cargo, sin que pueda estar sujeto a instrucción alguna en el desempeño del mismo.