Esta nueva fundación estará dirigida por un Patronato integrado por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), la Fundación Española de Ciencia y Tecnología (Fecyt), la Fundación Alonso Martín Escudero (Afame) y el Instituto Español de Oceanografía (IEO).

Entre sus funciones se encuentran el recopilar y difundir información sobre los proyectos de investigación, desarrollo e innovación tecnológica, sobre los congresos, seminarios, talleres y reuniones, sobre las empresas productoras y proveedoras y sobre la legislación.

Además, la fundación asesorará a empresas, investigadores y administraciones para la realización de trabajos de interés común y, para el desarrollo de la imagen de la acuicultura, elaborará un informe anual sobre el "Estado actual de la Acuicultura en España".

También se compromete a realizar estudios de producción científica, de producción acuícola, sobre necesidades y demandas del sector empresarial, sobre actividades acuícolas en países terceros, así como a la edición de publicaciones científicas y técnicas y monografías específicas.