El Plan Museográfico, arobado por el Real Patronato del museo el 25 de abril de 1997 y que ya ha comenzado a ejecutarse, considera de gran interés la utilización museística del claustro y parte del atrio adyacente de la Iglesia de San Jerónimo el Real.

Según el convenio, la Archidiócesis de Madrid cederá al Estado, gratuitamente y libre de cargas, la propiedad del solar delimitado por las calles de Moreto, Ruiz de Alarcón, Casado del Alisal y Academia. Un total de 1.742 mentros cuadrados de superficie, donde se encuentran atualmente ubidados el Claustro y la Parroquia de los Jerónimos.

Por su parte, el Ministerio de Educación y Cultura costeará la terminación de las obras de restauración de la igleisa por un importe máximo de 270 millones de pesetas. Además, financiará la construcción de un nuevo edificio de servicios parroquiales y viviendas por un importe límite de 700 millones.

El ministerio convocará un concurso para la redacción del proyecto de ampliación del Museo del Prado en el Claustro de los Jerónimos, qu incluirá también la fachada externa de edificios de servicios y viviendas parroquiales.

El Claustro de los Jerónimos formará parte de la ampliación del Museo del Prado, junto a los nuevos espacios expositivos conseguidos en el edificio Villanueva, la utilización del actual Museo del Ejército, las reformas del Casón del Buen Retiro y la adquisición del edificio de Aldeasa.