El Parlamento andaluz declaró parque natural en 1989 las 10.000 hectáreas de marismas, salinas, playas y pinaes de la Bahía de Cádiz, pero "el MOPT viene ignorando sistemáticamente esta realidad y sigue desarrollando proyectos de obras sin tener en cuenta los grandes valores ecológicos y paisajísticos de este espacio protegido ni su normativa legal de protección", según Fepg.

Las obras realizadas en este espacio protegido son, según los ecologistas, un paso elevado y vías de acceso en el cruce de las carreteras N-IV y N-340, en los términos de San Fernando y Chiclana (Cádiz); desdoble de la N-340, rellenos pra caminos paralelos a la N-340, entre las localidades gaditanas de Chiclana y Tres Caminos, y dragados en Sancti Petri y Río San Pedro.

Según los ecologistas, en la actualidad se tramitan varios proyectos "de enorme envergadura que atraviesan el parque natural y sin que los organismos rectores del mismo hayan tenido ningún tipo de comunicación oficial". Entre ellos destacan el desdoble de la N-IV entre Puerto Real y Tres Caminos, la variante de la N-IV entre El Puerto de Santa María y Puerto Real y e tercer acceso a Cádiz.

La Federación Ecologista Pacifista Gaditana considera que "estas obras ilegales pueden constitutir un presunto delito de prevaricación, por la tolerancia del director de la Agencia de Medio Ambiente, Francisco Blanco", y anuncia todo tipo de actuaciones para conseguir que el MOPT cumpla la legalidad vigente.