Este acuerdo se recoge en un convenio firmado por el subsecretario de Cultura, Enrique Linde; la viuda del historiador, HelenaPerenya; el consejero de Educación y Cultura de la Junta de Comunidades de Castilla-La Mancha, Santiago Moreno; el director de la Biblioteca Nacional, Carlos Ortega, y Fernando Ledesma en representación de la Real Fundación de Toledo.

Javier Malagón reunió en vida una importante biblioteca, cerca de 13.000 volúmenes sobre América y España, en la que se presta especial atención a la documentación referida a la ciudad de Toledo y que fue donada a la Biblioteca Pública de la ciudad.

La Real Fundació Toledo y el Ministerio de Cultura se encargarán, de mutuo acuerdo, de la edición del catálogo, mientras que la Biblioteca Nacional aportará sus equipos técnicos y un profesional especializado para informatizar los fondos bibliográficos.