En este inventario se contabilizan tanto especies en peligro crítico de extinción como en peligro de extinción, vulnerable o casi amenazadas de extinción, según informa la Junta.

En peligro crítico de extinción se encuentran especies como la focha moruna, con 8 parejas censadas, cerceta pardilla (19), avetoro común (8) y garcilla cangrejera (154). En peligro de extinción se hallan el morito común, que alcanza la cifra de 2.236 parejas, el chorlitejo patinegro (1.088), canastera común (1.195) y la malvasía cabeciblanca, con 21.

Se ha constatado la presencia de otras especies catalogadas como vulnerables a la extinción, algunas muy numerosas como es el caso del charrancito común, con 2.376 parejas, y la pagaza piconegra (2.169). En esta misma categoría se encuentran también la espátula común (759) la garza imperial (669), el pato colorado (108) y el avetorillo común, con 53 parejas reproductoras.

Del total de parejas nidificantes de fauna acuática amenazada censadas en Andalucía se ha detectado en los humedales de Huelva la presencia de un total de 5.218 parejas de aves y 19 especies diferentes; en Sevilla4.973 parejas y 21 especies; Cádiz, 4.248 y 20; Málaga, 2.740 y 21 especies; Almería, 1.601 parejas y 19 especies; Córdoba, 66 parejas y 9 especies; Jaén 45 y 8; y Granada, 10 parejas y 6 especies.

Andalucía presenta el 17% del total de las zonas húmedas españolas, que en superficie suponen el 56% de la extensión total de las áreas inundables españolas.