Los proyectos de la organización están presupuestados en más de 209 millones de pesetas. De esta cifra, un 73,3 por ciento cooresponde a fondos públicos; un 19,3 por ciento proviene de fondos privados; un 3,5 por ciento proviene de aportaciones de los beneficiarios, valorizados o en metálico; y el 1,4 por ciento provino de otras aportaciones.

El objetvo principal que se persigue con todos estos proyectos de cooperación sanitaria a medio y largo plazo es incentivar la salud en las regiones más pobres del planeta mediante la prevención, educación, curación y rehabilitación.

Medicus Mundi Madrid desarrolla en la actualidad seis proyectos, todos ellos en Latinoámerica, en países como Ecuador, República Dominicana, Honduras y Bolivia.

Medicus Mundi Madrid también participa, junto a otras ONG, en campañas como "Dividendo de Paz-Invertir en Paz" "Saber donar" o "Deuda Externa ¿Deuda Eterna?".

Medicus Mundi está reconocida oficialmente como órgano consultor de la Organización Mundial de la Salud (OMS). En 1991 recibió el Premio Príncipe de Asturias de la Concordia. Además es miembro fundador de la Coordinadora de Organizaciones para el Desarrollo.