La propuesta de restauración fue declarada de carácter urgente por el secretario de Estado de Cultura, Miguel Angel Cortés, y había sido formulada por la Subdirección General del Patrimonio Histórico Español, que consideró pertinente realizar esta rehabilitación por tratarse de un templo que fue declarado Monumento Histórico Artístico por decreto del 10 de octubre de 1980.

San Francisco el Grande fue proyectada por Francisco Cabezas, quin realizó las obras junto a Antonio Plo y Comín. La terminación y la fachada fue llevada a cabo por Francisco Sabatini y Miguel Fernández entre los años 1761 y 1784.