Retuerto es liceciada en Derecho por la Universidad Complutense de Madrid, diplomada en Derecho Comunitario por la Universidad de Granada y el Consejo General del Poder Judicial y Master en Derecho Comunitario por la Universidad Politécnica de Madrid.

Ha desempeñado, además, distintos cargos en la Administración. Así, fue vocal del Consejo General del Poder Judicial de 1996 a 2001. Anteriormente, de 1983 a 1996, formó parte de la Institución del Defensor del Pueblo, como adjunta segunda, posteriormente fue elegida po el Parlamento como adjunta primera y desempeñó el cargo de Defensor del Pueblo en funciones durante casi dos años (1993-1995).

Durante esta etapa dirigió entre otras el área de Sanidad de la institución. En este período fue la primera directora europea junto con los Ombudsman de Dinamarca, Holanda y Noruega del Instituto Internacional del Ombudsman, corporación de derecho público que agrupa a las instituciones no jurisdiccionales de protección de los Derechos Humanos, con sede en la Universidad de Alerta en Canadá.

Actualmente, Margarita Retuerto es miembro de la Comisión Internacional de Juristas, órgano consultivo de Naciones Unidas, cuyo fin es la defensa de la ley y la independencia de abogados, jueces y magistrados. Forma parte de su Comité Ejecutivo al mismo tiempo que de la Junta Directiva de la Sección Española.

Pertenece al Comité Científico-Jurídico de la Confederación de Familiares de Enfermos de Alzheimer, que estudia los aspectos jurídicos, económicos y éticos relacionados con botecnología aplicada a la prevención y tratamiento de las demencias degenerativas.

Margarita Retuerto es autora de diversos estudios y artículos especializados en publicaciones tanto nacionales como internacionales en materias relacionadas con el Derecho Internacional y los Derechos Humanos, el Defensor del Pueblo y el proceso jurídico de la construcción europea.

La recién nombrada Defensor del Paciente ha sido miembro del Comité Español contra el Racismo y del Comité Nacional para la conmemoracin del 50 Aniversario de la Declaración de los Derechos Humanos, en representación del Consejo General del Poder Judicial. Además, forma parte del Ilustre Colegio de Abogados de Madrid, de la Asociación Española de Mujeres Juristas y de la Asociación Europea de Mujeres Juristas (EWLA).