Una vez recibidas las transferencias sanitarias, la CAM gestiona 452 centros, entre ellos 24 hospitales, y cuenta con casi 62.000 empleados.

Sanidad dispone ahora de dos viceconsejerías, una dedicada a la Asistencia Sanitaria y otra a la Ordenación Sanitaria y Función Pública, una Secrearía General Técnica y siete direcciones generales: Farmacia y Productos Sanitarios; Régimen Económico, Infraestructruras y Recursos Humanos; Aseguramiento y Atención al Paciente; Salud Pública; Planificación Sanitaria, Innovación Tecnológica y Sistemas de Información; Calidad, Acreditación, Evaluación e Inspección, y Coordinación Sanitaria, Participación y Relaciones Institucionales.

Junto a la adscripción del organismo Agencia Antidroga, se crean en la Consejería de Sanidad cuatro entes públicos: Sevicio Madrileño de Salud; Instituto Madrileño de la Salud; Agencia de Formación, Investigación y Estudios Sanitarios, e Instituto de Salud Pública.