Durante los últimos cinco años se ha reducido el número de caballitos de mar a la mitad, y ya existe una determinada especie en el sur de Africa en alarma roja de extinción.

Entre las causas se encuentran el turismo, la contaminación del hábitat y su captura como reclamo turístico y por su valor para la medicina tradicional china, que lo considera útil para curar el asma y la impotencia.

El Zoo de Londres ha iniciado el proyecto internacional "Caballto de Mar" para intentar frenar su desaparición mediante el lanzamiento de estudios sobre su biología particular. La ignorancia hace que sean vendidos como mascotas, aunque, al carecer de un estómago normal, resulta difícil cuidarlos en cautividad.