El real decreto por el que se creaba esta comisión está acompañado por tres acuerdos. En el primero de ellos se encomienda a la comisión la coordinación de los planes humanitarios y las ayudas en relación a los refugiados y desplazados de Kosovo. El segundo establece el mismo mecanismo para los afectados por el huracán "Mitch", y el tercero hace referencia a la constitución de la comisión.

La comisión está compuesta por un presidente y dos vicepresidentes, que debeán tener, en los tres casos, la condición de miembros del Gobierno; y por un mínimo de tres vocales por cada departamento ministerial afectado.

Para la ayuda a los refugiados de Kosovo y los afectados por el huracán "Mitch", la comisión estará presidida por el vicepresidente primero del Gobierno, Francisco Alvarez Cascos, y tendrá dos vicepresidencias, ocupadas por el los ministros de Asuntos Exteriores, Abel Matutes, y Administraciones Públicas, Angel Acebes.

Entre las funciones de la comisión fguran la de impulsar las actuaciones que desarrollen la Administración General del Estado y sus organismos públicos en relación con las actuaciones humanitarias y de cooperación en casos de emergencia internacional, así como la colaboración con las comunidades autónomas y las corporaciones locales.