El cuartel donostiarra nunca dispuso de celdas y los arrestados eran alojados hasta 1995 en las dependencias anexas del cuarel en la calle Zumalacárregui, donde se ubican, entre otros servicios, el de intervención de armas.

Aquellos calabozos fueron cerrados por orden del gobernador civil de Guipúzcoa debido al mal estado que presentaban sus instalaciones. Desde entonces, los detenidos son alojados en unas dependencias del cuartel de manera temporal.

Cuando se trata de detenciones de terroristas el problema se solventa al ser enviados pocas horas después a Madrid, para pasar a disposición de la Audiencia Nacional, segn explicaron a Servimedia fuentes de la Subdelegación del Gobierno de Guipúzcoa.