El 29 de mayo de 1995 Mercedes se encontraba en la oficina de Médicos del Mundo en Mostar con el resto del equipo, cuando un hombre entró con un arma y disparó, lo que causó su muerte y heridas en miembros del equipo.

La persona que disparó, con problemas de salud mental, la consideró amiga de otra etnia y entendió que eso era motivo suficiente para acabar con su vida.