El reparto primará las regiones menos favorecidas, las que forman parte de la zona Objetivo 1, destinando a ellas el 55% de los recursos.

En este grupo se encuentran Andalucía, Asturias, Canarias, Castilla la Mancha, Extremadura, Galicia, Murcia, Valencia, Castilla y León, y Ceuta y Melilla.

Al resto de comunidades, las que se encuentran fuera del Objetivo 1, se destinará el 45% del presupuesto.

Con el fin de conseguir la implicación financiera de las Comunidades Autónomas en el PCCP, se asigna un porcentaje inicial fijo de recursos a cada una de ellas, y otro porcentaje en función de que la comunidad participe en la cofinanciación.

Así, para las Comunidades Objetivo 1 se establece que la parte variable ligada a la cofinanciación regional será hasta el 20%, mientras que, para las que están fuera, podrá llegar hasta el 30%.