En declaraciones a Onda Cero a propósito del "caso Atlético de Madrid", Núñez aseguró: "fue una pena cuando el último Gobierno socialista quiso transformar los clubes en sociedades anónimas. Yo fui el único que defendió que era un grave error, porque creo qu un club de fútbol es algo más, hay un sentimiento, representa a una ciudad, a un país".

Descartó que el club que presde haya incurrido en irregularidades tributarias, al señalar que "el Barça no puede pagar con dinero negro por la simple razón de que tenemos 105.000 socios y, por tanto, muy pocos ingresos por taquilla. Tampoco se puede alterar la contabilidad porque auditamos públicamente. Creo que el Barcelona tendría que haber sido el modelo de fiscalidad de los clubes de fútbol".

A su juicio, "mantener la independencia de un club es muy difícil, teniendo en cuenta cómo funciona el mundo político, mediático y emprsarial. El Barcelona ha aprovechado un momento donde realmente hay una verdadera competencia para adquirir los derechos de televisión. Ahora compiten el Grupo Telefónica y el Grupo Prisa. Telefónica tiene en estos momentos un derecho de opción sobre los derechos televisivos del Barcelona a partir del año 2003 por 16.000 millones de pesetas al año".