Alvarez fue encarcelado el 21 de diciembre en el centro penitenciario de Logroño por su presunta participación en el caso GAL, donde permaneció hasta el pasado día 7, en que fue conducido por orden del juez Baltasar Garzón a la prisión de Quatre Camins.

El ex policía fue detenido el día 20 de diciembre en Barcelona, cuando iba a entegarse en la comisaría del aeropuerto de El Prat, después de que el juez dictara una orden de búsqueda y captura contra él como presunto implicado en el secuestro de Segundo Marey.