Barrionuevo alega enemistad manifiesta por parte del ex vicepresidente del Consejo General del Poder Judicial, organismo desde el que se distinguió por su apoyo a la instrucción que del "caso GAL" realizó el juez Baltasar Garzón. Manzanares llegó a declarar que, aunque Barrionuevo resultase absuelto judicialmente, ello no demostraría su falta de implicación en los delitos cometidos por la banda GAL.

La recusación presentada ante el Tribunal Supremo puede retrasar la tramitación de "caso GAL", que deberá ser resuelta por el pleno del Alto Tribunal, salvo que José Luis Manzanares acepte la recusación.

La iniciativa recusadora de Barrionuevo se produce después de que Manzanares no haya mostrado su disposición a abstenerse en la votación de la Sala Segunda del Tribunal Supremo para decidir si llama a declarar a Felipe González en relación al sumario abierto por el secuestro de Segundo Marey.