La medalla fue creada por esta entidad en el año 2003, como distinción a las personas que han destacado en el estudio y la defensa de la memoria de Juan Martín, "El Empecinado", la Guerra de la Independencia, o los ideales que profesó Martín durante toda su vida como fueron "su amor a la libertad".

Con motivo del Bicentenario del comienzo de la Guerra de la Independencia, la medalla fue concedida también a la Ciudad de Medina de Rioseco, a Cabezón de Pisuerga, a la Academia de Infantería de Segovia, y a la Sociedad Filantrópica Milicia Nacional por su labor en el cuidado del Cementerio de la Florida de Madrid.