En la masacre, ocurrida en la misma Universidad de El Salvador, fueron asesinados los seis jesuitas españoles, así como una criada y su hija, ambas de nacionalidad salvadoreña. Los ocho autores materiales del asesinato se beneficiaron posteriormente de una amnistía decretada por el Gobierno de El Salvador cuano lo presidía la formación ultraderechista Arena.

Tojeira hizo este anuncio tras la visita a la universidad del presidente del Gobierno, José María Aznar, quien rindió tributo a los sacerdotes asesinados depositando una corona de flores sobre sus lápidas, dentro de los actos de su visita oficial a la República de El Salvador.

El rector explicó que este caso ya fue elevado a la Corte Interamericana de Justicia de la Organización de Estados Americanos (OEA), pero señaló que también vería con buenosojos que este asunto fuera investigado en España de manera parecida a como ha hecho el juez Baltasar Garzón con los españoles desaparecidos bajo el terror de la dictadura militar argentina.

Precisó que están a la expectativa de ver los resultados que da la investigación de Garzón, pero insistió en que "a nosotros nos gustaría que se siguiera un proceso parecido como el que se ha seguido en el caso de Argentina, que los tribunales españoles tomaran la inicitiva, y se procediera a pedir cuentas desde Esaña, ya que desde aquí no lo hemos podido conseguir".

El rector dijo que, aunque sí se conoce quienes fueron los autores materiales del asesinato, nunca se ha dicho la verdad de los autores intelectuales, los que instigaron la masacre.