Meñika fue detenido en un control de carreteras por la Guardia Civil en la nacional 634, a la altura de la localidad de Abadiño, cerca de Durango (Vizcaya). La Guardia Civil intervino en el vehículo un total de 90 "bonos" de 60 euros cada uno.

Tras el arresto, la Benemérita registró también la vivienda de este dirigente de Jarrai en el municipio de Zamudio, así como la "herriko taberna" de esta localidad.

Ibon Meñika es una de las 24 personas que el 20 de junio de 2005 fueron condenadas por la Sección Cuarta de la Sala de lo Penal de la Audiencia Nacional por su relación con la organización Jarrai-Haika-Segi, considerada la rama juvenil de ETA.

Esta sentencia de la Audiencia Nacional fue recurrida ante el Supremo. La fiscalía se ha opuesto a las alegaciones de los 24 condenados ante el Alto Tribunal y ha pedido que sólo se admitan los argumentos que la Asociación Víctimas del Terrorismo (AVT) presentó contra el citado fallo.

Tanto para la Fiscalía como para la AVT, los acusados en este caso debieron haber sido condenados por integración en organización terrorista, no por asociación ilícita.