Entre los programas de formación postgrado que ofrece la escuela se encuentran el "master" en administración de negocios ó MBA, en liderazgo estratégico, en recursos humanos; en el área jurídica, la escuela ofrece master en asesoría jurídica, en asesoría fiscal internacional, y en urbanismo y ordenación del territorio.

Según el director de la Escuela de Negocios San Pablo CEU, Ramón Gurriarán, "este proyecto espera tener más de 300 alumnos matriculads, entre los programas de horario intensivo, que concentrarán la actividad entre el viernes y el sábado, y el programa de horario completo, en el que se impartirán las clases de lunes a viernes".

Los requisitos que se exigen a las personas que quieran matricularse es una titulación superior, y pasar una prueba psicotécnica y una entrevista personal.

El coste medio de cada "master" oscila entre los 12.000 y 15.000 euros, aunque la fundación concede cada año unas 2.500 becas, y los masters durarán n año y comenzarán a impartirse a partir del próximo mes de octubre hasta junio de 2005.