Alfredo Sáenz se formó en la Universidad de Deusto, donde se doctoró en Derecho y Economicas. Su carrera profesional esta estrechamente relacionada con la dirección de empresas industrias metalúrgicas, entre 1966 y 1980 primero en la dirección de la empresa Tubacex; y posteriormente en 1980 fue miembro de los consejos de administración de Tubacex y de Altos Hornos de Vizcaya.

Es en la decada de los ochenta cuando Alfredo Sáenz se incorpora al mundo de lasfinanzas al entrar en el Banco de Vizcaya, entre los años 1980 y 1983; en 1982 se incorporó al consejos de administración de diferentes entidades, Banco Occidental, Banco de Credito Comercial, Banco Meridional, y Ahorrobank; es en 1983 cuando entra en el consejo de adminstración de Banca Catalana.

Ese mismo año fue nombrado presidente del consejo de Bancaya y del Banco de Barcelona. Otras entidades en las que estuvo fueron el Banco Industrial de Cataluña y el Banco Industrial del Mediterráneo. En la atualidad es vicepresidente del Banco Bilbao-Vizcaya y presidente de Banca Catalana.

La muerte de Pedro Toledo provocó una crisis de poder en el Banco Bilbao Vizcaya. En el transcurso del mismo, los antiguos consejeros del Vizcaya propusieron a Sáenz como copresidente de la entidad vasca.