En declaraciones a Servimedia, Miret Magdalena recordó que Isabel la Católica fue "la que inició la Inquisición y expulsó a los judíos y a os moriscos, precisamente porque quería hacer la unidad de España sobre la base de unidad de religión".

Recalcó que esta actuación de Isabel la Católica fue "un elemento tan negativo para nuestra historia y en general para la conducta de una gobernante a la que quieren declarar santa que no me parece nada ejemplar".

Además, Miret Magdalena se preguntó qué aporta esta reina a la sociedad actual española para que se tome como ejemplo, ya que las canonizaciones debe fundamentarse en la ejemplaridad e la persona a la que se pretende elevar a los altares.

Finalmente, el teólogo calificó de "razón infantil" que los obispos españoles hayan impulsado la canonización de Isabel la Católica con motivo de la celebración, en el año 2004, del quinto centenario de su muerte.