Esta institución tiene como finalidad esencial el fomento de la investigación y el estudio de la ciencia farmacéutica, continuando y ampliando la tradición y el legado científico de los farmacéuticos aragoneses.

Además, podrá realizar otras actividades, como la promoción de avances científicos, el asesoramiento a entidades públicas y privadas o la formación permanente. Los futuros miembros de la Academia serán personas que destaquen en el ámbito científico o técnico por sus aportaciones a la farmacia o ciencias afines.

Igualmente, se han aprobado los estatutos que habrán de regir la Academia, en los que se regula, entre otras cuestiones, la actividad que realizará la Academia para alcanzar sus fines, las distintas clases de académicos, la gestión y el gobierno de la Academia o el régimen jurídico de su patrimonio, así como el proceso inicial de constitución.