Aunque el juez instructor, Santiago Pedraz, archivó la causa en tres ocasiones, la Sala Segunda de lo Penal ordenó reabrir el caso. La Fiscalía no aprecia delito, pero Manos Limpias y la asociación Dignidad y Justicia, que ejercen la acusación popular, mantienen su acusación y piden 20 meses de cárcel para el edil.

Zapata será juzgado por la Sección Tercera de la Sala de lo Penal en la sede que la Audiencia Nacional tiene en la calle García Gutiérrez. El Tribunal estará presidido por el magistrado Alfonso Guevara y estará compuesto también por Ángeles Barreiro y Antonio Delgado.