Diversas organizaciones ecologistas han criticado lo que consideran excesiva cifra de visitantes, aunque la dirección de la reserva considera que pone en marcha ls medidas adecuadas para a la preservación de Doñana.

En la actualidad, los visitantes pueden acceder al parque a través de dos vías: una situada en Almonte (Huelva) y otra en Sanlúcar de Barrameda (Cádiz).

La primera está organizada por la cooperativa "Marismas del Rocío" y en ella los viajeros parten del centro administrativo de El Acebuche en vehículos todo-terreno que durante 4 horas recorren alrededor de 90 kilómetros en el interior de la reserva.

El itinerario se lleva a cabo en dos tunos -uno de mañana y otro de tarde- con un máximo de 125 personas.

La segunda modalidad es la que realiza el barco "Real Fernando", con capacidad para 28 personas, que atraviesa el curso del río Guadalquivir y que únicamente permite el recorrido peatonal de los visitantes en dos desembarcos dentro del parque.