Según informó este martes Ibidell, la aplicación informática, llamada MinerProt, es útil para priorizar la importancia de ciertas proteínas.

El equipo coordinado por una de las investigadoras de Ibidell, Àngels Sierra, ha empleado la aplicación informática junto con redes de interacción proteína-proteína para crear perfiles específicos de expresión de proteínas para diferentes metástasis de cáncer de mama, en cerebro, pulmón, hígado y hueso, estableciendo funciones prioritarias en cada una de ellas.

“La aproximación funcional, basada en la selección de las proteínas más representativas, puede servir para encontrar marcadores para predecir la evolución del proceso canceroso, así como para desarrollar futuras dianas terapéuticas”, informó Sierra.

“El principal objetivo de la investigación ha sido buscar un clasificador funcional que ayude a interpretar todos los datos referentes a las proteínas relacionadas con las metástasis del cáncer de mama, dado el gran número que se encuentra diferencialmente expresado y su complejidad de estudio. El clasificador indica las funciones celulares que pueden estar más representadas en un determinado tipo de célula metastásica. Sobre estas funciones, el clasificador nos indica qué proteína puede ser más importante para la función que hemos integrado”, explicó la investigadora.

“Así, partiendo de genes/proteínas previamente identificadas se clasifican atendiendo al grado de expresión diferencial (significación estadística), para luego organizarse en una red de interacción proteína-proteína. Es una forma práctica de filtrar la información, seleccionando las proteínas clave para definir funciones relevantes. Hemos seguido un enfoque basado en discriminar las funciones de las metástasis de cáncer de mama atendiendo a su organoespecificidad que permitiría el crecimiento celular en microambientes de órganos distantes como hueso, cerebro, hígado y pulmón”, añadió.

Sierra concluyó que “identificar interacciones letales entre proteína y proteína en las células cancerosas es una vía prometedora para futuros desarrollos de dianas terapéuticas y de fármacos cada vez más potentes y selectivos”.