Este protocolo es el órgano de autorregulación del ejercicio profesional del periodismo, desde la responsabilidad de los propios periodistas y de sus organizaciones profesionales.

La Comisión de Quejas y Deontología de la Federación de Asociaciones de Periodistas de España (Fape), que preside Manuel Núñez Encabo, se constituyó como órgano de autocontrol deontológico interno de la profesión periodística en 2004. Su objetivo es favorecer y promover el arbitraje, la mediación, el entendimiento y la recomendación de petición de disculpas.

La Fundación para la Comisión de Quejas y Deontología de la Fape, nacida en julio de 2011 y presidida por Elsa González como presidenta de la federación, pretende dar continuidad al trabajo de la comisión "desde la más estricta autonomía" y con la participación de todas las personas, empresas y entidades comprometidas con esta causa, como son las propias empresas periodísticas.