Felipe VI conocerá de primera mano las actividades del Cifas, que dirige y coordina el empleo de los sistemas conjuntos de inteligencia, vigilancia y reconocimiento (ISR, por sus siglas en inglés), así como la explotación de la información con las autoridades competentes. Además, atiende en su campo de actuación, las peticiones de información de inteligencia de las autoridades del Ministerio de Defensa.

El Jemad, actualmente el almirante general Teodoro Esteban López Calderón, fija las condiciones en las que el Cifas presta apoyo al Mando de Operaciones (MOPS) en determinadas operaciones militares. Asimismo, el Cifas asesora al Jemad y a los jefes de Estado Mayor de los Ejércitos y la Armada en materia de contrainteligencia militar y seguridad en la estructura orgánica de las Fuerzas Armadas. Además, contribuye al asesoramiento al Jemad en el nivel estratégico de las operaciones militares.

El Cifas en coordinación con el MOPS, planifica, dirige y, en su caso, ejecuta las actuaciones en materia de información geoespacial en el ámbito de la defensa para las operaciones. A estos efectos los órganos correspondientes de los Ejércitos y la Armada mantienen una dependencia funcional con el Centro de Inteligencia de las Fuerzas Armadas.

Finalmente, define en colaboración con el Estado Mayor Conjunto de la Defensa (Emacon) y el nuevo Mando Conjunto del Ciberespacio (MCCE), los requisitos operativos de los sistemas de observación de la Tierra de los que dispone España, por la importancia de la inteligencia de imágenes.