Covid-19

Un genotipo del coronavirus causó el 60% de los contagios en España antes del confinamiento

- La diversidad genómica en España es única en Europa, según un trabajo liderado por investigadores del CSIC

MADRID
SERVIMEDIA

El 60% de los casos de coronavirus en España durante la primera semana de marzo, esto es, antes del confinamiento domiciliario obligado por el estado de alarma, partieron de un solo genotipo del SARS-CoV-2, causante de la Covid-19.

Así se explica en un estudio realizado por investigadores del consorcio SeqCovid-Spain, liderado por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), que ha publicado un informe que muestra el mapa de la diversidad genética del SAR-CoV-2 durante los tres primeros meses de la epidemia -de febrero a abril-, es decir, durante la primera ola.

El estudio indica que la diversidad genómica del coronavirus en España es única en Europa y más cercana a los genotipos del virus circulante en Asia entre finales de 2019 y principios de 2020. Este hecho concuerda con la introducción temprana del virus en el país, sobre todo a partir de la segunda mitad de febrero y con una expansión muy veloz a todo el territorio nacional para finales de ese mes.

El consorcio SeqCovid-Spain aúna los esfuerzos de más de 30 hospitales de toda España, así como de laboratorios de genómica y salud pública. Como resultado, España es ahora el segundo país de Europa con más muestras recogidas del genoma del virus y el cuarto del mundo, con un total de 4.244 secuencias, de las cuales el consorcio ha secuenciado 3.800.

Gran parte del esfuerzo de secuenciación se realizó en las instalaciones de la Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica (Fisabio), pero también en diversos hospitales de España, entre los que se encuentran el Hospital General Universitario Gregorio Marañón de Madrid, el Hospital Clínic de Barcelona, el Centro de Investigación Biomédica de La Rioja, el Hospital San Pedro de Logroño, el Hospital de Elche y el Hospital Universitario Son Espases de Palma de Mallorca. El consorcio está financiado por la PTI Salud Global del CSIC y por el Instituto de Salud Carlos III, como mayor contribuyente.

Los análisis científicos identifican un mínimo de 519 entradas en el país dentro de las 2.170 secuencias del principio de la epidemia analizadas. No todas tuvieron un éxito epidemiológico y sólo unas pocas llegaron a generar un número sustantivo de casos. Sin embargo, las pocas que cuajaron tuvieron un gran peso en la epidemia.

"Entre las secuencias analizadas se ha identificado un genotipo que generó el 30% de todos los casos secuenciados, llegando a representar un 60% en la primera semana de marzo”, indica Iñaki Comas, del Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV-CSIC), que añade: “Una reconstrucción detallada de dicho genotipo demuestra que se introdujo múltiples veces y simultáneamente desde Italia, por lo menos en Madrid y Valencia, antes de que el país transalpino diera la voz de alarma”.

Comas subraya que "al éxito de estas introducciones contribuyeron eventos de superdispersión, como un funeral en Vitoria, que ayudaron a este genotipo concreto a mantenerse y expandirse rápidamente". “La alta movilidad entre provincias españolas hizo el resto para que el genotipo se convirtiera en el más exitoso de la primera ola en España”, agrega.

CONFINAMIENTO EFICAZ

Los análisis también demuestran la alta efectividad del confinamiento durante marzo y abril, que prácticamente eliminó estos genotipos exitosos, ya que no se han vuelto a detectar en la segunda oleada. “De hecho, en la segunda ola se están viendo nuevos genotipos aparecer con patrones similares a los mencionados en este trabajo”, señala Comas.

Este investigador advierte de que "uno de los mensajes más importantes extraídos del informe es la necesidad de tomar medidas de restricción a tiempo para contener estos genotipos antes de que se expandan y tengan un peso tan importante en la epidemia". "Como ocurre en otras partes del mundo, al éxito de estos genotipos contribuye una combinación de múltiples introducciones asociadas a eventos de superdispersión y a una alta movilidad”, recalca.

Además, el informe sugiere la necesidad de poner en marcha sistemas de vigilancia temprana que identifiquen la expansión de determinados genotipos localmente y entre provincias, de manera que se puedan tomar decisiones informadas sobre las actuaciones a realizar para contenerlos.

En el informe también trabajaron la viróloga Mireia Coscolla, del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), del CSIC y la Universidad de Valencia, junto con Fernando González Candelas, responsable de la Unidad Mixta de Investigación en Infección y Salud Pública de Fisabio, de la Generalitat Valenciana.

(SERVIMEDIA)
26 Oct 2020
MGR/mjg