Los fondos que distribuye ECHO no los gestionan los gobiernos de los países a los que van destinados, sino que financian proyectos que realizan las organizaciones con las que esta oficina tiene firmados acuerdos.

Las ONGS que firmarán e convenio son ACSUR-Las Segovias; Acción contra el Hambre; Nuevo Futuro; Cáritas; Farmacéuticos Sin Fronteras; Intermón; Médicos del Mundo; Médicos Sin Fronteras; Médicos Mundi; el Movimiento por la Paz; el Desarme y la Libertad; Nous Camins; Paz y Tercer Mundo, y Solidaridad Internacional.