Según el PP, este archivo es el tercero en importancia de España en cuant al número y el valor de sus fondos, tras el Archivo de Indias y el de Simancas.

El PP califica de "impresentable" que se acumulen sin contestar las cientos de miles de consultas que recibe el Archivo General de la Marina por parte de investigadores de América, España y Europa, lo que a su juicio "daña el prestigio científico e investigador de España en el extranjero".