La cesión gratuita de uso se realizó por acuerdo del Gobierno de Navarra de 10 de abril de 2006, con las condiciones de que la cesión es por 50 años, a contar desde que el edificio se ponga a disposición del Estado, para la construcción, gestión y explotación de un parador nacional, revirtiendo el inmueble a la Comunidad Foral en caso de cambio de destino.

Además, se debe permitir el acceso gratuito a los visitantes no alojados en el parador al claustro interior del monasterio, por su destacado valor histórico y cultural, y el libre acceso a la iglesia. La iglesia y su sacrístia quedan excluidas de la cesión.

El Monasterio de Irache tiene una superficie de 6.905 metros cuadrados en planta y el conjunto arquitectónico se compone de un edificio rectangular de planta baja más dos alturas con dos patios interiores y una iglesia, que ocupa 1.073 de planta. La finca colindante, que también ha sido cedida, es un terreno de 5.019,38 metros cuadrados que ocupa la parcela 730 del polígono 2 junto al conjunto del monasterio.

No es el primer acuerdo firmado, ya que el Ejecutivo foral y el Instituto de Turismo de España (Turespaña) firmaron el 5 de mayo de 2003 un convenio de colaboración para situar en Estella o su entorno un parador nacional que reforzase la oferta de alojamiento de calidad en esta zona de la Ruta Cultural Europea del Camino de Santiago.